1989年1月,和平日促進會、台灣人權促進會、台灣政治受難者聯誼會、長老教會等團體發起二二八公義和平運動。
台灣省文獻委員會則在民進黨議員壓力下,紀錄二二八事件的口述歷史。宗教界、學生、社會運動團體陸續加入後,新版歷史教科書首度提及事件。
1991年1月,民間更成立研究小組,於同年12月舉辦首次學術研討會;行政院也成立研究二二八事件小組,邀集學者蒐集相關資料。1992年2月,政府公布首份官方報告《二二八事件研究報告》。
李登輝、陳水扁、馬英九分別在1995年、2007年、2010年任職總統時,代表政府向受害者道歉。